Ouvrages

• Du jihad à la fitna, Paris, Bayard / BNF, 2005.
• The roots of radical Islam, Londres, Saqi, 2005.
• Jihad : The trial of political Islam, Londres, I. B. Tauris, 2004.
• The war for muslim minds: Islam and the West, Cambridge, Mass / Londres, Belknap Press, 2004.
• Fitna : guerre au coeur de l'islam : essai, Paris, Gallimard, 2004.
• Bad moon rising : A chronicle of the Middle East today, Londres, Saqi, 2003.
• Jihad : expansion et déclin de l'islamisme, Paris, Gallimard, [2000], édition révisée 2003.
• La Revanche de Dieu : Chrétiens, juifs et musulmans à la reconquête du monde, Paris, Le Seuil, [1991], 2003.
• Chronique d'une guerre d'Orient, automne 2001. Brève chronique d'Israël et de Palestine, avril-mai 2001, Paris, Gallimard, 2002.
• Allah in the West : Islamic movements in America and Europe, Oxford, Polity, 1997.
• A l'ouest d'Allah, Paris, Le Seuil, [1994], 1996.
• The revenge of God : The resurgence of Islam, Christianity and Judaism in the modern world, Cambridge, Polity, 1994.
• Le Prophète et le Pharaon. Aux sources des mouvements islamistes, Paris, Le Seuil, [1984], édition révisée 1993.
• Les banlieues de l'islam. Naissance d'une religion en France, Paris, Le Seuil, [1987], 1991.

Direction d'ouvrages

• Exils et royaumes : les appartenances au monde arabo- musulman aujourd'hui : études réunies pour Rémy Leveau , Paris, Presses de Sciences-Po, 1994.
• Les politiques de Dieu, Paris, Le Seuil, 1992.
• Intellectuels et militants de l'islam contemporain, (avec Y. Richard), Paris, Le Seuil, 1990.
• Les musulmans dans la société française, (avec Rémy Leveau), Paris, Presses de Sciences-Po, 1988.

• Religion et politique
• Formes contemporaines du communautarisme